Benoît Paillaugue est né le 17 novembre 1987 à La Rochelle. C’est en Charente-Maritime qu’il commence le rugby. Il intègre le centre de formation du Stade Français et y débute logiquement sa carrière professionnelle. Pendant 3 ans, il fait partie des Espoirs mais ne joue que 60 minutes sur les pelouses du Top14 lors de la saison 2007/2008. Il est à l’époque entraîné par Fabien Galthié. Il rejoint donc ensuite le club d'Auch en Pro D2 où il ne joue que six mois puisqu’il rejoint l’effectif du MHR en 2009. Devenu une figure incontournable du club, il y est lié jusqu’en 2020.